Na preddiplomskom studiju izvode se dva programa: studij Filozofije i studij Filozofije i religijskih znanosti. Programi preddiplomskih studija u trajanju od tri godine pružaju opće obrazovanje u disciplinama filozofije i religijskih znanosti, uvode u znanstvenu metodologiju te razvijaju kritičko mišljenje.
Diplomski studij traje dvije godine, izvodi se u dva programa: studij Filozofije i studij Religijskih znanosti. Tijekom studija studentima se pruža dublja izobrazba na polju filozofije i religijskih znanosti, razvijaju se vještine argumentiranja i kritičkog analiziranja te se detaljnije uvodi u metode znanstvenoga istraživanja.
Studentima ne pružamo samo obrazovanje i iskustva koja ih definiraju za uspjeh u karijeri. Pomažemo im da uspiju u svojoj karijeri – da otkriju područje svog interesa i budu najbolji u tome.
Programi studija FFRZ Sveučilišta u Zagrebu izrađeni su na zasadi duge i bogate tradicije visokoga školstva i pedagogije znanstveno-nastavnoga rada isusovaca.